2023年1月,我中心硕士研究生张晓熙在国际学术期刊《The Plant Genome》(植物科学2区,IF:4.219)上发表题为“Genome-wide identification of HD-ZIP gene family and screening of genes related to prickle development in Zanthoxylum armatum”的研究论文。张晓熙为第一作者,张威威副教授和许锋教授为通讯作者,学院为第一署名单位。
竹叶花椒是亚洲地区一种重要的药食同源的经济作物,其茎和叶脉上分布着大量的皮刺,给生产上带来了许多麻烦。HD-ZIP基因家族是植物所特有的一类转录因子,在植物的形态建成、信号转导、次生代谢物合成等生物过程中发挥着重要的作用。然而,对可能参与竹叶花椒皮刺发育相关的HD-ZIP基因信息知之甚少。在该研究中,作者从竹叶花椒基因组中共鉴定了76个ZaHDZ基因,并根据系统发育分析将它们分为四个亚科(Ⅰ~IV),基因结构及保守基序分析进一步支持了这一分类结果。76个ZaHDZ基因在染色体上分布不均匀。进化分析揭示了ZaHDZ基因的扩张主要源于全基因组复制事件或片段复制,且它们在进化过程中经历了强烈的纯化选择压力。在ZaHDZ基因的启动子区域共鉴定了47种顺式元件,主要包括激素响应、胁迫响应及对植物生长发育调控的相关元件。利用qRT-PCR分析了IV亚科ZaHDZ基因在五种组织中以及四种激素处理下的表达水平。最终预测出ZaHDZ16是最有可能参与竹叶花椒皮刺发育相关的候选基因。这些结果有助于更好地理解HD-ZIP家族基因的特征,并为进一步研究竹叶花椒皮刺发育相关基因的功能奠定了基础。
该研究得到了国家重点研发计划“花椒和油橄榄种质创制与良种选育”项目(2019YFD1001200)的资助。